Przy Muzeum Kresów w Lubaczowie istnieje Archiwum Zakładowe, które gromadzi, ewidencjonuje i udostępnia dokumenty związane z działalnością placówki. Dokumenty udostępniane są za wiedzą i zgodą Dyrektora. Akta tajne załatwia i przechowuje zgodnie z odpowiednią instrukcją i obowiązującymi przepisami Dyrektor Muzeum